引起月经不调的原因有两大类：
1神经内分泌功能失调引起：主要是下后脑－－垂体 －卵巢轴的功能不稳定或是有缺陷，即月经病。
2器质病变或药物等引起：包括生殖器官局部的炎症、肿瘤及发育异常、营养不良；颅内疾患；其他内分泌功能失调如甲状腺肾上腺皮持功能异常、糖尿病、席汉氏病等；肝脏疾患；血液疾患等使用治疗精神病的药物；内分泌制剂或采取宫内节育器避孕者均可能发生月经不调。某些职业如长跑运动员容易出现闭经。此外某些妊娠期异常出血也往往被误认为是月经不调。
临床上诊断神经内分泌功能失调性的月经病必须要排除上述的各种器质性原因。
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